Anaconda3（二）、创建虚拟环境，tensorflow安装和bioconda安装
一、启动Anaconda3
使用系统的Anaconda3
source /appsnew/source/Anaconda3.sh ##默认源
source /appsnew/source/Anaconda3-2022.05-local.sh##北极星源
使用自己安装的Anaconda3（参考Anaconda3（一））
source /lustre1/gaog/gaogg/source/Anaconda3.sh ##
二、创建~/.conda的软连接
如果home目录下没有足够空间：
北极星集群：
rm -rf ~/.conda ; mkdir /lustre1/${USER}/.conda##(子账号： mkdir /lustre1/`groups`/${USER}/.conda）
ln -s /lustre1/${USER}/.conda ~/.conda##(子账号： ln -s /lustre1/`groups`/${USER}/.conda ~/.conda）
教学集群：
rm -rf ~/.conda ; mkdir /gpfs1/${USER}/.conda;
ln -s /gpfs1/${USER}/.conda ~/.conda
三、创建激活，查看，删除，重命名虚拟环境
1、创建默认虚拟环境
conda create -n AI python=3.8 ## 安装到 ~/.conda/envs 下
conda activate AI ###激活虚拟环境
conda deactivate
删除：conda remove -n AI --all
重命名：
conda create -n py3.8 --clone AI;
conda remove -n AI --all
2、创建指定虚拟环境
1）北极星主账号
conda create python=3.8 -p /lustre1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI ##指定路径安装
conda activate /lustre1/${USER}/Anaconda3/.conda/envs/AI
conda install -c bioconda cutadapt
conda deactivate
##注意，退出后如果没有提示符，执行 source /etc/profile 或者 PS1='[럹W]# '
##进入后没有提示符，可以输入 PS1='($CONDA_DEFAULT_ENV)[럹W]# '
删除：conda env remove --prefix=/lustre1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI
重命名：同1
2）北极星子账号
conda create python=3.8 -p /lustre1/`groups`/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI ##指定路径安装
conda activate /lustre1/${USER}/`groups`/Anaconda3/.conda/envs/AI
conda install -c bioconda cutadapt
conda deactivate
##注意，退出后如果没有提示符，执行 source /etc/profile 或者 PS1='[럹W]# '
##进入后没有提示符，可以输入 PS1='($CONDA_DEFAULT_ENV)[럹W]# '
删除：conda env remove --prefix=/lustre1/`groups`/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI
重命名：同1
3）教学集群
conda create python=3.8 -p /gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI ##指定路径安装
conda activate /gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI
conda install -c bioconda cutadapt
conda deactivate
##注意，退出后如果没有提示符，执行 source /etc/profile 或者 PS1='[럹W]# '
##进入后没有提示符，可以输入 PS1='($CONDA_DEFAULT_ENV)[럹W]# '
删除：conda env remove --prefix=/gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI
重命名：同1
3、查看虚拟环境
conda info --e; conda env list
三、tensorflow安装和bioconda安装
这里以教学集群为例子：
conda activate /gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3/.conda/envs/AI
cat /appsnew/source/conda.bjx >~/.condarc
conda clean -i
conda install -c bioconda cutadapt
conda install tensorflow-gpu
conda install r
四、不同源切换：
cat /appsnew/source/conda.tsu >~/.condarc;conda clean -i
conda.bfsu # 外国语学院，以下均含有bioconda r
conda.bjx #北极星本地源，最快
conda.douban #豆瓣源
conda.tsu #清华源
清掉源 rm -rf ~/.condarc ;conda clean -i
切换错误，忽略：如下报错，可以忽略
